Photoshopのレイヤーのサムネイルはデフォルトで、サムネイルサイズ：小、サムネイルの内容：ドキュメント全体を表示、になっています。

そのためドキュメント全体が大きくてレイヤー内の要素が小さいとレイヤーのサムネイルからレイヤー内の要素を確認することができません。

以下のように操作することでレイヤーのサムネイルを変更し、レイヤー内の要素を確認することができます。

レイヤーパネル右上のボタンをクリック→パネルオプション→レイヤーパネルオプションのサムネイルサイズを大きいものに変更、サムネイルの内容を「ドキュメント全体を表示」から「レイヤー範囲のみを表示」に変更

変更後のレイヤーは以下のようになります。レイヤー内の要素が確認でき、シェイプレイヤーの右下に表示されるバウンディングボックスも確認しやすくなります。